新疆大学科技园成立于2001年12月。2002年5月，经自治区人民政府批准 “新疆大学科技园作为乌鲁木齐高新技术产业开发区的区外园”，2005年12月，由国家科技部、教育部认定为“国家级大学科技园”，是新疆维吾尔自治区唯一一家国家级大学科技园。2010年10月，经国家教育部、科技部评审认定为全国首批国家级“高校学生科技创业实习基地”。2011年12月由乌鲁木齐市劳动和社会保障局授予“全国创建创业型城市乌鲁木齐市创业孵化基地”。2012年12月,经国家工信部命名为“国家中小企业公共服务示范平台”。2013年6月，乌鲁木齐高新区（新市区）人力资源和社会保障局认定认定科技园为“乌鲁木齐高新技术产业开发区（乌鲁木齐是新市区）”创业园区。2014年12月，科技园加入“泛西北大学科技园联盟”。2015年5月，新疆国家大学科技园昌吉高新区分园成立。2016年1月，科技园获得自治区级“天山众创空间”认定。2016年2月，科技园获得国家级“众创空间”认定。2016年6月，科技园获得高新区科技局“众创空间”认定。2016年8月，科技园获得市级“红山众创空间”认定。2016年8月，科技园经科技厅认定“自治区级科技企业孵化器”。2016年11月，科技园经人社厅认定为“自治区级创业孵化基地”。